KAPA RiboErase Globin 血液RNA-Seq的利器

更新時間：2021-02-04 點擊次數(shù)：2626

對血液樣本進行RNA測序時，如果不進行適當?shù)奶幚恚瑫绊憸y序的結果。

*，真核生物細胞含有一些高豐度RNA，其中含量高的是核糖體RNA（rRNA），而血液的RNA中含量第二高的就是珠蛋白（globin）RNA。這兩種RNA占血液樣本總RNA的85%以上。

如果不進行處理就建庫測序，高豐度RNA占據(jù)著大量的數(shù)據(jù)，不僅浪費了測序成本，更淹沒了目標RNA的數(shù)據(jù)，特別是一些低豐度但起著關鍵調(diào)控的RNA或者是罕見融合位點，使我們難以比較表達的差異化和特異性。

利用mRNA的polyA尾特點來富集mRNA的方法，雖然可以去除核糖體RNA，但并不能去除globin mRNA，同時其它的非編碼RNA的品種也會一并丟失。另外，在RNA樣本的質量不高時，由于降解導致polyA尾的不完整，這種方法也不適用。

這些問題通過采用RNA酶H法的KAPA新品Globin RNA去除寡核苷酸加上RiboErase (HMR)核糖體RNA去除試劑盒即可輕松解決！

RNA酶H法的原理：rRNA及globin RNA與特異互補的DNA寡核苷酸鏈雜交，接著與DNA鏈雜交的RNA品種被RNA酶H特異消化去除，引入的DNA鏈則通過后續(xù)的DNA酶消化而去除。

產(chǎn)品應用

可同時去除細胞質5S、5.8S、18S及28S 核糖體RNA，線粒體12S及16S 核糖體RNA，以及珠蛋白globin mRNA

適合物種：人、小鼠、大鼠

可用于檢測帶polyA尾的RNA（成熟mRNA）及不帶polyA尾的RNA（包括非編碼RNA及前體RNA）

高質量與低質量RNA樣本同樣適用

優(yōu)異表現(xiàn)

穩(wěn)定去除99.9% rRNA及99.9% globin mRNA

低至25ng的血液來源RNA樣本也可獲得豐富轉錄本信息

一天內(nèi)快速完成RNA富集及建庫流程（~6.5小時）（配套KAPA RNA Hyper建庫試劑盒）

降低非特異性去除比例（與非酶去除法比較）

KAPA更高效、重復性更好

▲ 圖一 KAPA 實驗流程與I品牌同類產(chǎn)品相比，KAPA對globin mRNA及rRNA的去除效率更高，重復性更好。測序文庫從25/100/1000ng人血來源的RNA樣本制備，實驗流程采用了相應產(chǎn)品推薦的實驗方案。

KAPA助您發(fā)現(xiàn)更多

▲ 圖二 KAPA 實驗流程提升了*轉錄本的檢測數(shù)量

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